非酶多糖清除劑(RNA樣品專用)操作步驟:
1 切取含有目的DNA 片段的瓊脂糖凝膠條帶。
● 盡量切除不含有目的DNA 部分的凝膠,減少凝膠體積,提高DNA 回收率。
● 切膠時,請使用長波長UV (360 nm )光盒。且不要將DNA 長時間暴露在紫外燈下,以防DNA 損傷。
2 稱取凝膠的重量近似地確定其體積。
● 凝膠重量的稱量方法:取1.5 ml 離心管電子天平稱初質(zhì)量,切膠裝在離心管后稱終質(zhì)量,兩者差即為膠的質(zhì)量。不同廠家離心管的重量可能有差異,因此,每個離心管的重量需單獨稱量。
3 按照每100 mg 瓊脂糖凝膠對應100 μl 溶液BD 的比例,向離心管中加入溶液BD。
4 50 ℃水浴7-10min,直至凝膠完全溶化。期間需要振蕩混合3 次。
● 瓊脂糖必須完全融化,以免堵塞柱子,嚴重影響DNA 片段的回收效率。
● 如果總體積大于500 μl,可適當增加溶膠時間。
● 若此時溶液變紅,可加10 μl 3M NaAC (pH 5.2)。
5 將步驟4 所獲溶液置于DNA 純化柱中,靜置2min 。
● 膠塊完全溶解后最好將膠溶液溫度降至室溫再上柱,因為純化柱在較高溫度時結(jié)合DNA 的能力較弱。
6 12,000 rpm 離心1min。若溶液量大于DNA 純化柱的容積,可分兩次離心,棄濾液。
● 此時DNA 片段被吸附于DNA 純化柱中的硅膠膜上。
7 加入500 μl 溶液BD。12,000 rpm, 離心1min,棄濾液
8 加入500 μl 溶液PE。12,000 rpm, 離心1min,棄濾液。
● 溶液PE 初次使用前用無水乙醇按1: 4 稀釋,即含80% 乙醇。
● 此步驟的作用是將硅膠膜上吸附的蛋白、鹽等雜質(zhì)洗脫,以獲得高質(zhì)量DNA 片段。
9 加入500 μl 溶液PE。12,000 rpm, 離心1min,棄濾液。
10 12,000 rpm 離心 3min ,以徹底去除純化柱中的液體。
● 此步驟的作用是去除殘留乙醇,避免殘留乙醇影響后續(xù)酶促反應。同時也利于DNA 片段的充分溶解。
11 將離心柱置于新的1.5 ml 離心管中。向純化柱的中央處,懸空滴加30-100 μl 溶液Eluent (60℃預熱),靜置2min 。12,000 rpm 離心1min,管底即為目的DNA 片段。貯存于-20℃。
● 溶液Eluent 可用無菌雙蒸水代替,但其pH 需為8.0-8.5,加入體積視DNA 目的片段的多少、用戶對目的片段濃度要求而定。
● 對溶液Eluent 60℃預熱,會提高提取DNA 目的片段的產(chǎn)量。
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